Nghiên cứu xác định kiểu gen của vi rút BK ở bệnh nhân ghép thận tại Bệnh viện Quân y 103

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

Nghiên cứu xác định kiểu gen của vi rút BK

ở bệnh nhân ghép thận tại Bệnh viện Quân y 103

Hoàng Xuân Sử ¹, Trương Qúy Kiên², Phạm Quốc Toản², Lê Việt Thắng²

Nguyễn Thanh Xuân², Lê Thị Bảo Quyên³, Lê Đình Nam⁴, Nguyễn Đắc Thắng¹

Hoàng Xuân Cường¹, Đinh Thị Thu Hằng¹, Hồ Anh Sơn¹, Hoàng Văn Lương¹

¹Học viện Quân y

²Bệnh viện Quân y 103

³Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội

⁴Bệnh viện Quân y 354

TÓM TẮT

Mục tiêu: Xác định sự phân bố và lưu hành kiểu

gen vi rút BK trên bệnh nhân ghép thận.

1, 3/8 (37,5%) thuộc phân nhóm IV/c-1. Không có

sự khác biệt giữa các kiểu gen BKV liên quan đến

tuổi, giới, các chỉ số xét nghiệm và tình trạng BKVN

là không có ý nghĩa thống kê (p>0,05).

Kết luận: Nghiên cứu chỉ ra kiểu gen BKV-I là

kiểu gen lưu hành phổ biến, tiếp theo là BKV-IV

trên những bệnh nhân ghép thận. Nghiên cứu

này giúp cung cấp những đặc điểm di truyền

phân tử BKV góp phần giám sát BKV ở bệnh

nhân ghép thận.

Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Tổng

số 131 bệnh nhân ghép thận được thu thập tại khoa

ận và Lọc máu, Bệnh viện Quân y 103. Mẫu máu,

nước tiểu được thu thập và tách chiết DNA sử dụng

cho phản ứng Nested - PCR khuếch đại đoạn gen

VP1 của BK virus (BKV). Những mẫu BKV dương

tính được giải trình tự và xây dựng cây chủng loại

phát sinh xác định kiểu gen bằng phương pháp

Neighbor-joining dựa trên phần mềm Mega 7.

Kết quả: 40 mẫu dương tính với BKV được giải

trình tự và phân tích loài, trong đó chỉ phát hiện được

BKV- I (62,5%) và BKV- IV (37,5%). Trong BKV- I,

chỉ quan sát được phân nhóm I/b-1 (62,5%), không

phát hiện được các phân nhóm khác. Tuy nhiên,

BKV- IV cho thấy sự đa dạng của các phân nhóm

như sau: IV/a-1 (26,67%), IV/a-2 (6,67%), IV/c-

1 (66,66%). Với 8 bệnh nhân bị BKVN (BK Virus

Nephropathy), được khẳng định bằng sinh thiết

thận, 5/8 (62,5%) bệnh nhân thuộc phân nhóm I/b-

Từ khóa: Vi rút BK, kiểu gen BKV, ghép thận.

ĐẶT VẤN ĐỀ

Human polyomavirus BK (BKV) thuộc họ

Polyomaviridae, đặc trưng bởi bộ gen DNA kép,

khép vòng, được phân lập lần đầu tiên từ mẫu nước

tiểu của bệnh nhân sau ghép thận với biến chứng

hẹp niệu quản [18]. uật ngữ “BK” có nguồn gốc

từ chữ cái đầu của bệnh nhân đầu tiên phát hiện

nhiễm virus trong nước tiểu vào năm 1971. BKV

lây nhiễm ở mọi lứa tuổi với tỷ lệ huyết thanh

dương tính ở người lớn dao động từ 60% tới 100%.

Ngày nhận bài: 10/6/2020

Ngày phản biện: 30/7/2020

Ngày chấp nhận đăng: 5/8/2020

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

6

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

Sau khi nhiễm BKV nguyên phát, BKV tồn tại ở III hiếm gặp hơn. BKV-I tiếp tục được chia thành

dạng tiềm ẩn trong đường tiết niệu sinh dục và chỉ 4 phân nhóm I/a, I/b-1, I/b-2 và I/c; trong khi đó

bắt đầu tái hoạt động nhân lên mạnh mẽ, phá hủy BKV-IV đa dạng hơn với 6 phân nhóm IV/a-1, IV/

các tế bào đường tiết niệu khi hệ miễn dịch bị ức a-2, IV/b-1, IV/b-2, IV/c-1, IV/c-2. Sự phân bố đa

chế hoặc suy giảm. Ngoài bài tiết trong đường tiết dạng của các kiểu BKV cũng như phân nhóm BKV

niệu, BKV cũng xuất hiện trong huyết tương của ở quần thể người đã được nghiên cứu ở nhiều nước,

bệnh nhân ghép thận.

trong đó phân nhóm Ia phổ biến ở châu Phi, phân

Ở bệnh nhân ghép thận, tỷ lệ lưu hành BKV nhóm I/b-1 phổ biến ở Đông Nam Á, phân nhóm

dao động từ 10% tới 60%, trong số đó 1% tới 10% I/b-2 phổ biến ở châu Âu và phân nhóm I/c phổ

dẫn đến BKVN, đặc trưng bởi hoại tử ống thận biến ở Đông Bắc Á [8], [15]. Cũng như phân nhóm

cũng như tình trạng viêm thận kẽ. Sự tiến triển của I, mỗi phân nhóm BKV-IV tương ứng với một vị trí

BKVN thường xảy ra mà không có dấu hiệu lâm địa lý nhất định [11]. Các nghiên cứu gần đây cho

sàng hoặc triệu chứng rõ ràng ngoại trừ tăng nồng thấy kiểu gen BKV có liên quan đến yếu tố độc lực

độ creatinin huyết thanh, nếu không phát hiện kịp và bệnh sinh của BKVN. Tuy nhiên, ở Việt Nam,

thời 15% đến 80% trường hợp BKVN dẫn tới mất chưa có nghiên cứu nào xác định tỷ lệ lưu hành kiểu

ghép trong vòng 5 năm đầu tiên [3]. Mặt khác, gen của BKV ở bệnh nhân ghép thận. Do đó, mục

BKVN thường dễ bị bỏ sót chẩn đoán hoặc nhầm tiêu chính của nghiên cứu nhằm xác định sự phân

lẫn với tình trạng thải ghép cấp tính hoặc độc tính bố và lưu hành kiểu gen BKV trên những bệnh nhân

của thuốc ức chế miễn dịch.

ghép thận tại Bệnh viện Quân y 103.

Bộ gen BKV có kích thước gần 5,3 kb, được chia

thành 3 vùng: vùng kiểm soát sớm, vùng kiểm soát VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

muộn và vùng không mã hóa [3], trong đó vùng Bệnh nhân và mẫu bệnh phẩm

không mã hóa giữ chức năng điều tiết, vùng mã hóa

Mẫu máu và nước tiểu của 131 bệnh nhân ghép

sớm mã hóa cho các kháng nguyên T lớn, T nhỏ thận được thu thập tại Khoa ận Lọc máu, Bệnh

và vùng mã hóa muộn mã hóa agnoprotein và các viện Quân y 103. Mẫu nước tiểu được xử lý bằng

protein cấu trúc (Viral Protein: VP1, VP2 và VP3). cách ly tâm ở 3200 rpm, 30 phút, bỏ dịch, thu cặn.

VP1 là thành phần chính của vỏ capsid, giúp duy trì Mẫu máu được ly tâm 3000 rpm, 10 phút và tách

cấu trúc capsid, đồng thời các vòng lặp bên ngoài lấy huyết tương. Huyết tương và cặn nước tiểu được

VP1 đóng vai trò quan trọng trong việc làm trung bảo quản -80^oC cho tới khi tách DNA. ông tin

gian gắn kết với thụ thể tế bào chủ cũng như chịu lâm sàng và cận lâm sàng được thu thập cho phân

trách nhiệm cho sự tồn tại của các biến thể kháng tích sự liên quan với kiểu gen của BKV.

nguyên BKV [2], [14]. Dựa trên trình tự toàn bộ Tách DNA

gen hoặc sự đa dạng trình tự vùng VP1, Jin và cs

BKV-DNA được tách chiết từ 200 µl huyết tương

[5] đã phân loại các chủng BKV hiện có thành bốn hoặc cặn nước tiểu theo quy trình bộ kit GeneJET

kiểu gen kí hiệu từ BKV I-IV, đồng thời những kiểu Whole Blood Genomic DNA Puriﬁcation Mini

gen này có mối tương quan rõ rệt với các kiểu huyết Kit (ermo Scientiﬁc, Mỹ). DNA được ly giải

thanh học [7]. BKV- I được xác định là kiểu gen lưu trong 54 µl dung dịch Elution buﬀer. Các mẫu sau

hành phổ biến nhất trên thế giới (80%), tiếp theo đó được bảo quản lâu dài ở -80^oC cho đến khi thực

là BKV- IV (15%), trong khi đó BKV- II và BKV- hiện phản ứng Nested - PCR.

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

0

7

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

Nested PCR và giải trình tự

Germany) với chu trình nhiệt như sau: Vòng 1

Các cặp mồi nhằm khuếch đại vùng gen VP1 (95^oC x 5 phút)(94^oC x 30 giây; 58^oC x 30 giây;

được thay đổi một số trình tự so với công bố trước 72^oC x 45 giây) x 35 chu kỳ, (72^oC x 7 phút); vòng

đây nhằm phù hợp với các chủng Việt Nam [6], [9]. 2 (95^oC x 5 phút)(94^oC x 30 giây; 42^oC x 30 giây;

ành phần phản ứng PCR trong thể tích 20 µl gồm: 72^oC x 30 giây) x 35 chu kỳ, (72^oC x 7 phút). Sản

1X Dream Taqgo master mix, 0,2 µM hỗn hợp mồi phẩm Nested - PCR được điện di kiểm tra trên gel

xuôi - ngược, 5 µl DNA khuôn, điều chỉnh H₂O khử agarose 1,2% TBE 0,5X, nhuộm ethidium bromide,

ion đủ thể tích 20 μl. Phản ứng PCR được khuếch chụp ảnh và lưu kết quả trên máy UVP (Eppendorf,

đại trên máy Mastercycler (Eppendorf, Hamburg, Hamburg, Germany).

Bảng 1. Các cặp mồi sử dụng trong nghiên cứu

Primers

Sequences

Position

1361-1381

1919-1940

1630-1649

1937-1956

1651-1675

Size (bp)

References

_

BKV S

ATC AAA GAA CTG CTC CTC AAT

GCA CTC CCT GCA TT CCA AGG G

CAA GTG CCA AAA CTA CTA AT

TGC ATG AAG GTAAG CAT GC

AGG AGT AGA AGT TCT AGA AG

580 bp

9

_

BKV AS

BKV-F

BKV-R

327 bp

287 bp

6

BKV-seq

Các chủng tham chiếu

26 trình tự genome BKV tương ứng với các kiểu gen của BKV được thu thập từ Genbank để so sánh với

trình tự các chủng BKV phân lập từ các bệnh nhân ghép thận trong nghiên cứu này. ông tin của các trình

tự tham chiếu được thể hiện ở Bảng 2.

Bảng 2. Các trình tự tham chiếu

Mã số

Phân nhóm

I/b-1

I/b-2

I/a

Quốc gia

Nhật Bản

Ireland

Nhật Bản

Netherland

Nhật Bản

USA

AB211369

AB365177

JN192433

AB301086

AB211370

AB369092

NC001538

V01108

I/a

USA

AB211381

AB211372

AB211386

AB263920

I/c

III

II

Nhật Bản

Anh

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

8

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

AB269859

AB269869

AB268868

AB211389

AB269867

AB269858

AB269863

AB211391

AB217919

KF468291

AB269857

AB269835

AB269834

AB211387

IV/a-1

IV/a-2

IV/c-1

IV/b-1

IV/c-2

IV/b-2

Philippine

Việt Nam

Nhật Bản

Việt Nam

Trung Quốc

Nhật Bản

Đức

Trung Quốc

Nhật Bản

Giải trình tự gen và xây dựng cây chủng loại

phát sinh

Tổng số 131 bệnh nhân ghép thận được đưa vào

nghiên cứu với độ tuổi trung bình là 39,73 10,68.

Sản phẩm Nested-PCR được tinh sạch và giải Tỷ lệ bệnh nhân nam chiếm 69,47%, nữ chiếm

trình tự trực tiếp trên máy 3130 XL (ABI, Mỹ). 30,53%. Các chỉ số xét nghiệm gồm số điểm hòa hợp

Trình tự vùng VP1 thu được sử dụng phần mềm HLA trung bình là 3,57 1,47, nồng độ creatinine

BioEdit 7.0 và MEGA7.0 để phân tích và xây dựng tháng đầu sau ghép là 116,53 33,40. Trong số 131

cây phát sinh loài các chủng BKV phân lập ở bệnh bệnh nhân, 8 trường hợp được chẩn đoán BKVN

nhân ghép thận theo phương pháp Neiborjoining (6,11%) bằng sinh thiết thận.

(ML) với hệ số bootstrap lặp lại 1000 lần.

Nested - PCR phát hiện BKV

Mẫu bệnh phẩm của 131 bệnh nhân được tách

DNA và thực hiện Nested - PCR với các cặp mồi

đặc hiệu. Trong số đó, 40 mẫu (30,53%) dương tính

với BKV, được thể hiện qua hình ảnh điện di với

băng đặc hiệu có kích thước 327 bp (hình 1). Các

băng đều sáng, đậm nét và không có sản phẩm phụ.

KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN

ông tin chung về bệnh nhân

Bảng 3. Đặc điểm chung của nhóm bệnh nhân nghiên cứu

Đặc điểm

ông số

Nam

Nữ

91 (69,47%)

40 (30,53%)

39,73 10,68

116,53 33,40

3,57 1,47

Giới tính

Tuổi

Creatinin T1 (µmol/ml)

HLA mismath

BKVN

8 (6,11%)

Hình 1. Nested PCR gen VP1

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

0

9

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

Chú thích: 1, 2, 3: các mẫu dương tính với BKV, 4: Việt Nam. Phân tích sâu hơn về trình tự dưới loài,

đối chứng âm, 5: Marker 100 bp (ermo Fisher, Mỹ) 27/27 mẫu BKV-I thuộc về phân nhóm I/b-1,

Xác định sự lưu hành kiểu gen của BKV ở không phát hiện được các phân nhóm I/b-2, I/a

bệnh nhân ghép thận

hay I/c. Tuy nhiên, BKV- IV thể hiện sự đa dạng

40 mẫu dương tính với BKV bằng Nested - PCR các phân nhóm cao hơn: 10 mẫu thuộc phân nhóm

được tinh sạch và giải trình tự. Dựa vào các trình tự IV/c-1, 4 mẫu thuộc phân nhóm IV/a-1 và 1 mẫu

tham chiếu được công bố trên Genbank cùng với thuộc nhóm IV/a-2 (Bảng 4). Trong số 8 bệnh

kết quả giải trình tự của 40 mẫu dương tính, cây nhân bị BKVN, phát hiện được 5/8 mẫu (62,5%)

chủng loại phát sinh được xây dựng theo phương thuộc phân nhóm I/b-1, 3/8 mẫu (38,5%) thuộc

pháp Neighbor-joining (Hình 2). Kết quả phân phân nhóm IV/c-1. Kết quả phân tích sự phân bố

tích bằng cây chủng loại phát sinh cho thấy: 25 và sự khác biệt giữa các kiểu gen BKV liên quan

mẫu (62,5%) thuộc BKV-I, 15 mẫu (37,5%) thuộc đến tuổi, giới, các chỉ số xét nghiệm và tình trạng

BKV- IV, không phát hiện được BKV-II, III trong BKVN là không có ý nghĩa thống kê (p>0,05).

các mẫu bệnh phẩm của bệnh nhân ghép thận tại Kết quả được trình bày ở bảng 5.

Bảng 4. Sự phân bố các phân nhóm của BKV

BKV- I (n=25)

BKV- IV (n=15)

IV/b-1

I/a

I/-b1

I/b-2

I/c

IV/a-1

IV/a-2

IV/c-1

IV/c-2

0

25

0

4

1

0

10

0

(0%)

(100%)

(0%)

(26,67%)

(6,67%)

(0%)

(66.66%)

(0%)

Bảng 5. Sự phân bố kiểu gen BKV theo các chỉ số lâm sàng và cận lâm sàng

BKV-I

(n=25)

BKV-IV

ông số

p

(n=15)

38,94 8,49

4 (26,67%)

11 (73,33%)

1,91 1,93

134,06 39,62

3 (20%)

Tuổi

41,12 10,94

6 (24%)

0,50

1

Nữ

Giới tính

Nam

19 (76%)

ời gian sau ghép (năm)

Creatinin T1 (µmol/ml)

BKVN

2,42 2,63

126,16 33,86

5 (20 %)

0,51

0,50

1

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

10

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

Genotype I

Genotype III

Genotype II

Genotype IV

Hình 2. Cây phát sinh loài của trình tự gen VP1 các chủng BKV phân lập ở miền Bắc Việt Nam với các chủng

tham chiếu, sử dụng phần mềm MEGA7 theo phương pháp Neighbor joining với hệ số bootstrap lặp lại 1000 lần

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

0

11

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

chiếm ưu thế (76,5%). H. Boukoum và cộng sự cũng

đưa ra nhận định không có sự liên quan giữa kiểu gen

và tình trạng BKVN (p>0,05), mặc dù cả hai bệnh

nhân bị BKVN đều thuộc phân nhóm I/b-2. Trong

khi đó, nghiên cứu của Pastrana và cs. (2013) [13] chỉ

ra rằng BKV - IV chiếm tỷ lệ cao hơn ở bệnh nhân bị

BKVN sau ghép thận so với bệnh nhân sau ghép chỉ

có BKV dương tính trong máu và nước tiểu. Một số

nghiên cứu khác cũng chỉ ra mối liên hệ giữa kiểu gen

BKV-II, III, IV với nguy cơ bị BKVN cao hơn ở bệnh

nhân ghép thận [10], [16]. Nghiên cứu gần đây của

Johannes Korth và cộng sự cho thấy BKV-I chiếm tỷ lệ

cao với 82%, tiếp theo là BKV-IV (14%) và cuối cùng

là BKV-II (4%). Điểm đáng chú ý là bệnh nhân BKVN

do BKV-II và IV được phát hiện với tỷ lệ cao hơn so

với bệnh nhân bị BKVN do BKV-I ((8/10 (80%) so

với 17/46 (37%); p = 0,001). Trong nghiên cứu này

chúng tôi chỉ ra BKV- I xuất hiện ở nhóm bệnh nhân

BKVN cao hơn (5/8 bệnh nhân) có thể do BKV- I

sao chép hiệu quả hơn BKV- IV trong tế bào biểu

mô thận cũng như BKV- I chiếm ưu thế trong dân

số Việt Nam [12]. Kết quả của chúng tôi khi so sánh

sự khác biệt giữa các kiểu gen BKV liên quan đến

tuổi, giới, các chỉ số xét nghiệm và tình trạng BKVN

cho thấy không có ý nghĩa thống kê (p>0,05). Tuy

nhiên, nghiên cứu này chưa được hỗ trợ đầy đủ để

đánh giá tính mức độ liên quan của kiểu gen BKV,

tải lượng vi rút BKV trong máu và nước tiểu đối với

nguy cơ bệnh thận do BKV, do đó, một nghiên cứu

lớn hơn là cần thiết để kiểm tra giả thuyết này.

BÀN LUẬN

BKV có 4 kiểu gen chính là BKV-I, II, III, IV lưu

hành trên thế giới và sự phân bố của các kiểu gen cũng

như các phân nhóm phụ thuộc vào các vùng địa lý

khác nhau. Trong đó, BKV- I phổ biến nhất trên toàn

thế giới, chiếm tỷ lệ 70%-80% [15], tiếp đến là BKV-

IV chiếm 15%-25%, được phát hiện ở châu Âu, châu

Á nhưng không phát hiện ở châu Phi. BKV- II và BKV-

III rất hiếm gặp ở mọi vùng địa lý [4]. BKV- I có 4 phân

nhóm gồm I/a, I/b-1, I/b-2 và I/c nhưng nguồn gốc

và sự phân bố của các phân nhóm là khác nhau. Phân

nhóm I/a có nguồn gốc ở châu Phi, I/b-1 có nguồn

gốc từ Đông Nam Á, I/b-2 đến từ châu Âu và I/c chủ

yếu ở Đông Bắc Á. Trong nghiên cứu này, khi phân

tích trình tự DNA của vùng gen VP1 cho thấy BKV- I

là kiểu gen chiếm ưu thế (62,5%), tiếp đến là BKV-IV

(32,5%). Phân tích sâu hơn để xác định phân nhóm,

25/25 mẫu thuộc BKV- I ở những bệnh nhân ghép

thận tại miền Bắc trong nghiên cứu này đều thuộc

nhóm I/b-1. Kết quả này phù hợp với sự phân bố kiểu

gen BKV trên thế giới cũng như nguồn gốc và sự phân

bố nhóm I/b-1 ở Đông Nam Á trong các nghiên cứu

trước đây [1], [4], [17].

Nhiễm BKV và BKVN là một vấn đề thách thức

lâm sàng ở bệnh nhân sau ghép thận khi mà các lựa

chọn trong điều trị còn hạn chế, phụ thuộc nhiều

vào kinh nghiệm của bác sĩ. Việc theo dõi điều trị

bệnh nhân sau ghép thận đóng vai trò rất quan trọng

trong duy trì chức năng thận ghép, giảm thiểu tối đa

nguy cơ mất mô ghép hay suy chức năng thận ghép.

Trong nghiên cứu này, khi phân tích kiểu gen BKV

của 8 bệnh nhân BKVN được khẳng định bằng sinh

thiết thận, 5/8 (62,5%) thuộc nhóm I/b-1; 3/5

(37,5%) thuộc nhóm IV/c-1, và sự khác biệt này

không có ý nghĩa thống kê (p>0,05). Nghiên cứu

của của H. Boukoum và cộng sự (2016) trên 34 mẫu

bệnh phẩm (máu hoặc nước tiểu) của bệnh nhân

ghép thận tại Tunisia cho thấy BKV- I có tỷ lệ lưu

hành cao nhất (79,5%), trong đó phân nhóm I/b-2

KẾT LUẬN

Nghiên cứu phân bố và lưu hành kiểu gen của

BKV ở bệnh nhân ghép thận tại Việt Nam cho thấy

chỉ phát hiện BKV-I và BKV-IV, trong đó BKV-I

chiếm ưu thế (62,5% so với 37,5%). Việc xác định

kiểu gen BKV có thể giúp dự báo mối liên quan

tiềm tàng giữa diễn tiến gây bệnh của BKV và tiến

triển của BKVN ở bệnh nhân ghép thận.

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

12

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

SUMMARY

Objectives: is study aims to investigate the distribution of BK virus genotypes among renal

transplant recipients.

Patients and methods: A total of 131 patients who underwent kidney transplantation in the department

of Nephrology and Dialysis, Military Hospital 103. Genotyping of BK virus was performed using Nested -

PCR, sequenced and aligned with reference sequences retrieved from Genbank for phylogenetic analysis.

Results and Discussion: Among 131 recipients of kidney transplants analyzed. Genotyping of

BKV was performed successfully in 40 out of the 131 patients by Nested - PCR. BKV-I was detected in

25 of 40 (62.5%) patients, and 15 out of 40 (32.5%) belonging to BKV-IV; no cases of BKV- II or III

were observed. Using phylogenetic analysis of the subgroups, BKV-I/b-1 was found the predominant

subgroup (100%), whereas BKV-IV included 26.67% of IV/a-1, 6.67% of IV/a-2 and 66.66% of IV/c-1,

respectively. In 8 patients diagnosed BKVN, 5 of them were infected with subgroup I/b-1 (62.5%) and

3 cases were infected with subgroup IV/c-1 (32.5%). No signiﬁcant diﬀerence between BKV genotypes

was observed in relation to age, sex, HLA mismatch, creatinine at month 1, BKVN.

Conclusion: is study indicated that the BKV-I was predominant, followed by BKV-IV among recipients

of renal transplant in Vietnam.

Keywords: BK virus, Genotypye, Renal Transplant.

TÀI LIỆU THAM KHẢO

1. Chen Q. et al. (2006), “Subtype IV of the BK polyomavirus is prevalent in East Asia”, Archives of virology,

151(12), pp. 2419-2429.

2. Dugan A. S. et al. (2007), “Identiﬁcation of amino acid residues in BK virus VP1 that are critical for

viability and growth”, Journal of virology, 81(21), pp. 11798-11808.

3. Hirsch H. H. et al. (2005), “Polyomavirus-associated nephropathy in renal transplantation:

interdisciplinary analyses and recommendations”, Transplantation, 79(10), pp. 1277-1286.

4. Ikegaya H. et al. (2006), “Identiﬁcation of a genomic subgroup of BK polyomavirus spread in European

populations”, Journal of general virology, 87(11), pp. 3201-3208.

5. Jin L. et al. (1993), “Genomic typing of BK virus in clinical specimens by direct sequencing of polymerase

chain reaction products”, Journal of medical virology, 41(1), pp. 11-17.

6. Jin L. et al. (1995), “Prevalence and distribution of BK virus subtypes in healthy people and

immunocompromised patients detected by PCR-restriction enzyme analysis”, Clinical and diagnostic virology,

3(3), pp. 285-295.

7. Knowles W. A. et al. (1989), “Serological typing scheme for BK‐like isolates of human polyomavirus”,

Journal of medical virology, 28(2), pp. 118-123.

8. Krumbholz A. et al. (2006), “Prevalence of BK virus subtype I in Germany”, Journal of medical virology,

78(12), pp. 1588-1598.

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

0

13

NGHIÊN CỨU LÂM SÀNG

9. Ledesma J. et al. (2013), “BK polyomavirus genotyping at inter‐and intra‐patient level in Spain”, Journal

of medical virology, 85(8), pp. 1402-1408.

10. Matsuda Y. et al. (2011), “A rapid and eﬃcient method BK polyomavirus genotyping by high‐resolution

melting analysis”, Journal of medical virology, 83(12), pp. 2128-2134.

11. Nishimoto Y. et al. (2007), “An Asian origin for subtype IV BK virus based on phylogenetic analysis”,

Journal of molecular evolution, 65(1), pp. 103-111.

12. Nukuzuma S. et al. (2006), “Subtype I BK polyomavirus strains grow more eﬃciently in human renal

epithelial cells than subtype IV strains”, Journal of general virology, 87(7), pp. 1893-1901.

13. Pastrana D. V. et al. (2013), “BK polyomavirus genotypes represent distinct serotypes with distinct

entry tropism”, Journal of virology, 87(18), pp. 10105-10113.

14. Stehle T. et al. (1994), “Structure of murine polyomavirus complexed with an oligosaccharide receptor

fragment”, Nature, 369(6476), p. 160.

15. Takasaka T. et al. (2004), “Subtypes of BK virus prevalent in Japan and variation in their transcriptional

control region”, Journal of General Virology, 85(10), pp. 2821-2827.

16. Tremolada S. et al. (2010), “Rare subtypes of BK virus are viable and frequently detected in renal

transplant recipients with BK virus-associated nephropathy”, Virology, 404(2), pp. 312-318.

17. Zheng H.-Y. et al. (2007), “Relationships between BK virus lineages and human populations”,

Microbes and infection, 9(2), pp. 204-213.

18. Hirsch H. H. and Steiger J. (2003), “Polyomavirus BK”, e Lancet Infectious Diseases, 3(10), p. 611.

|

TẠP CHÍ NỘI KHOA VIỆT NAM SỐ 18/2020

14